Hochentwickelte Massenspektrometrie
Dauer der Förderung: 2017-2025

Projektleiter
Zusammenfassung
Das Z04-Zentralprojekt wird dem Konsortium Zugang zu verschiedenen Massenspektrometrie-Methoden zur Proteom-Analyse zur Verfügung stellen. Die Arbeitsgruppe hat langjährige Erfahrung bezüglich der Entwicklung und Anwendung verschiedener Methoden hinsichtlich der Analyse spezifischer Teilproteome und bei der automatischen Probenvorbereitung für die Proteomik. Im Rahmen des SFB 1324 werden wir Unterstützung bei der globalen Proteom- und Phoshoproteom-Analyse, Sekretomanalyse sowie bei der Identifizierung von Interaktionspartnern gewährleisten, wodurch neue Erkenntnisse hinsichtlich des Wnt-Signalwegs, der Transportmechanismen und der nachgeschalteten Faktoren gewonnen werden können.

Projektbezogene Publikationen
Cracking chromatin with proteomics: From chromatome to histone modifications
Proteomics. 2022 May 28:e2100206. doi: 10.1002/pmic.202100206. Online ahead of print. PMID: 35633285
Mehr erfahrenGenomic rewiring of SOX2 chromatin interaction network during differentiation of ESCs to postmitotic neurons
Cell Syst. 2020 Jun 24;10(6):480-494.e8. doi: 10.1016/j.cels.2020.05.003. Epub 2020 Jun 17.
PMID: 32553182
Mehr erfahrenProtease‐resistant streptavidin for interaction proteomics
Rafiee MR, Sigismondo G, Kalxdorf M, Förster L, Brügger B, Béthune J, Krijgsveld J. Mol Syst Biol. 2020 May;16(5):e9370. PMID: 32400114
Mehr erfahrenMulti-level and lineage-specific interactomes of the Hox transcription factor Ubx contribute to its functional specificity
Nat Commun. 2020 Mar 13;11(1):1388. doi: 10.1038/s41467-020-15223-x. PMID: 32170121
Mehr erfahrenAutomated sample preparation with SP3 for low-input clinical proteomics
Mol Syst Biol. 2020 Jan;16(1):e9111. doi: 10.15252/msb.20199111. PMID: 32129943
Mehr erfahrenThe human RNAbinding proteome and its dynamics during arsenite-induced translational arrest
Cell. 2019 Jan 10;176(1-2):391-403.e19. doi: 10.1016/j.cell.2018.11.004. Epub 2018 Dec 6. PMID: 30528433
Mehr erfahrenSingle-pot, solid-phase-enhanced sample preparation for proteomics experiments
Spatial Tissue Proteomics Quantifies Inter- and Intratumor Heterogeneity in Hepatocellular Carcinoma (HCC)
Mol Cell Proteomics. 2018 Apr;17(4):810-825. doi: 10.1074/mcp.RA117.000189. Epub 2018 Jan 23. PMID: 29363612
Mehr erfahrenExpanding the circuitry of pluripotency by selective isolation of chromatin-associated proteins
Mol Cell. 2016 Nov 3;64(3):624-635. doi: 10.1016/j.molcel.2016.09.019. Epub 2016 Oct 20. PMID: 27773674
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