Z03

Hochentwickelte genetische Screens und Genom-Editierung

Dauer der Förderung: 2017-2029

Projektleiter

Prof. Dr. Michael Boutros

 Project Leader A01, Z01, Z03

Zusammenfassung

Die Genom Engineering und Screening Plattform Z03 bietet allen CRC 1324 Mitgliedern Zugang zu innovativen Genom Engineering Methoden und Hochdurchsatz-Screening-Technologie. Z03 hat Knock-out Zelllinien generiert und eine große Sammlung transgener sgRNA Linien für die bedingte Mutagenese in vivo bereitgestellt. Darüber hinaus hat Z03 verschiedene Knock-in Zelllinien mit Fluorophor-Insertionen im endogenen Lokus erstellt und Genom Editierung Ansätze für die in vivo Mutagenese und Basen-Editierung weiterentwickelt. Auch zukünftig wird Z03 alle SFB-Mitglieder mit hochmodernen Genome Editierungs- und Screening Technologien unterstützen.

Projektbezogene Publikationen

Haemodynamic control of zonated liver function via instructive vascular Wnt signalling

Lee KH, Jakab M, Uvarovskii A, Papageorgiou D, Inverso D, Shi J, Riedel M, Gehrs S, Kulkarni S, Bobe S, Ali A, Gallage S, Siegmund S, Gahn J, Blankenhorn L, Buettner M, Poschet G, Richter K, Voloshanenko O, Ola R, Korff T, Kiefer F, Heikenwalder M, Boutros M, Niehrs C, Mogler C, Krijgsveld J, Anders S, Augustin HG. Nat Commun. 2026 Aug 22;17(1):8821. doi: 10.1038/s41467-026-76966-7. PMID: 42632839

Mehr erfahren
Ras-MAPK inhibition induces AXIN1 loss in colorectal cancer by mTOR associated suppression of protein synthesis

Venkatachalam N, Wang L, Muthukumarana N, Ihnatko R, Krijgsveld J, Skabkina O, Leipertz A, Chen Y, Sui P, Zheng Q, Tong P, Liu X, Descot A, Schewe M, Diamante G, Jackstadt R, Brochhausen C, Betge J, Boonekamp K, Boutros M, Stoecklin G, Ebert M, Schott J, Zhan T. Cell Commun Signal. 2026 May 27;24(1):324. doi: 10.1186/s12964-026-02963-4. PMID: 42204589

Mehr erfahren
Improved in vivo gene knockout with high specificity using multiplexed Cas12a sgRNAs

Port F, Buhmann MA, Zhou J, Stricker M, Vaughan-Brown A, Michalsen AC, Roßmanith E, Pöltl A, Großkurth L, Huber J, Menendez Kury LB, Weberbauer B, Hübl M, Puscher E, Heigwer F, Boutros M. Nat Commun. 2026 Jan 15;17(1):877. doi: 10.1038/s41467-026-68434-z.

Mehr erfahren
Wnt10b signaling regulates replication stress-induced chromosomal instability in human cancer

Haas A, Wenz F, Hattemer J, Wesslowski J, Davidson G, Voloshanenko O, Boutros M, Acebron SP, Bastians H. Life Sci Alliance. 2025 Aug 22;8(11):e202503295. doi: 10.26508/lsa.202503295. Print 2025 Nov. PMID: 40846632

Mehr erfahren
Combined MEK and PARP inhibition enhances radiation response in rectal cancer

Xiao Q, Riedesser JE, Mulholland T, Li Z, Buchloh J, Albrecht P, Yang X, Li M, Venkatachalam N, Skabkina O, Klupsch A, Eichhorn E, Wang L, Belle S, Schulte N, Schmitz D, Froelich MF, Trikhirhisthit K, Valentini E, Boonekamp KE, Petersen Y, Miersch T, Burgermeister E, Herskind C, Veldwijk MR, Brochhausen C, Ihnatko R, Krijgsveld J, Kurth I, Zhu Y, Ma Y, Cao K, Boutros M, Ebert MP, Zhan T, Betge J. Cell Rep Med. 2025 Aug 5:102284. doi: 10.1016/j.xcrm.2025.102284. Online ahead of print.

Mehr erfahren
WNT5a export onto extracellular vesicles studied at single-molecule and single-vesicle resolution

Schubert A, Mongkolsittisilp A, Kobitski A, Schulz M, Voloshanenko O, Schaffrinski M, Winkler N, Neßling M, Richter K, Kranz D, Nienhaus K, Jäger D, Trümper L, Büntzel J, Binder C, Nienhaus GU, Boutros M. FEBS J. 2025 Apr 1.

Mehr erfahren
A temperature-tolerant CRISPR base editor mediates highly efficient and precise gene editing in Drosophila

Doll RM, Boutros M, Port F. Sci Adv. 2023 Sep;9(35):eadj1568. doi: 10.1126/sciadv.adj1568. Epub 2023 Aug 30. PMID: 37647411

Mehr erfahren
The Roles of Secreted Wnt Ligands in Cancer

Werner J, Boonekamp KE, Zhan T, Boutros M. Int J Mol Sci. 2023 Mar 10;24(6):5349. doi: 10.3390/ijms24065349. PMID: 36982422

Mehr erfahren
The role of Evi/Wntless in exporting Wnt proteins

Wolf L, Boutros M. Development. 2023 Feb 15;150(3):dev201352. doi: 10.1242/dev.201352. Epub 2023 Feb 10.
PMID: 36763105

Mehr erfahren
Blockade of Wnt Secretion Attenuates Myocardial Ischemia-Reperfusion Injury by Modulating the Inflammatory Response

Meyer IS, Li X, Meyer C, Voloshanenko O, Pohl S, Boutros M, Katus HA, Frey N, Leuschner F. Int J Mol Sci. 2022 Oct 14;23(20):12252. doi: 10.3390/ijms232012252.
PMID: 36293109

Mehr erfahren
Tissue-Specific CRISPR-Cas9 Screening in Drosophila

Port F, Boutros M. Methods Mol Biol. 2022;2540:157-176. doi: 10.1007/978-1-0716-2541-5_7. PMID: 35980577

Mehr erfahren
Superresolution microscopy localizes endogenous Dvl2 to Wnt signaling-responsive biomolecular condensates

Schubert A, Voloshanenko O, Ragaller F, Gmach P, Kranz D, Scheeder C, Miersch T, Schulz M, Trümper L, Binder C, Lampe M, Engel U, Boutros M. Proc Natl Acad Sci U S A. 2022 Jul 26;119(30):e2122476119. doi: 10.1073/pnas.2122476119. Epub 2022 Jul 22. PMID: 35867833

Mehr erfahren
Allele-specific endogenous tagging and quantitative analysis of β-catenin in colorectal cancer cells

Ambrosi G, Voloshanenko O, Eckert AF, Kranz D, Nienhaus GU, Boutros M. Elife. 2022 Jan 11;11:e64498. doi: 10.7554/eLife.64498.
PMID: 35014953

Mehr erfahren
EVI/WLS function is regulated by ubiquitination and linked to ER-associated degradation by ERLIN2

Wolf LM, Lambert AM, Haenlin J, Boutros M. J Cell Sci. 2021 Jul 19:jcs.257790. doi: 10.1242/jcs.257790. Online ahead of print.
PMID: 3427964

Mehr erfahren
Wnt10b GSK3β dependent Wnt/STOP signaling prevents aneuploidy in human somatic cells

Lin YC, Haas A, Bufe A, Parbin S, Hennecke M, Voloshanenko O, Gross J, Boutros M, Acebron SP, Bastians H. Life Sci Alliance. 2020 Nov 30;4(1):e202000855. Print 2021 Jan.
PMID: 33257473

Mehr erfahren
Extracellular vesicles and oncogenic signaling

Schubert A, Boutros M. Mol Oncol. 2020 Nov 18. doi: 10.1002/1878-0261.12855. PMID: 33207034

Mehr erfahren
Multiplexed conditional genome editing with Cas12a in Drosophila

Port F, Starostecka M, Boutros M. Proc Natl Acad Sci U S A. 2020 Aug 25:202004655.

PMID: 32843348

Mehr erfahren
eGFP-tagged Wnt-3a enables functional analysis of Wnt trafficking and signaling and kinetic assessment of Wnt binding to full-length Frizzled

Wesslowski J, Kozielewicz P, Wang X, Cui H, Schihada H, Kranz D, Karuna M P, Levkin P, Gross JC, Boutros M, Schulte G, Davidson G. J Biol Chem. 2020 May 7. pii: jbc.RA120.012892. PMID:32381507

Mehr erfahren
gscreend: modelling asymmetric count ratios in CRISPR screens to decrease experiment size and improve phenotype detection

Imkeller K, Ambrosi G, Boutros M, Huber W. Genome Biol. 2020 Mar 2; 21(1):53. PMID: 32122365

Mehr erfahren
A Large-Scale Resource for Tissue-Specific CRISPR Mutagenesis in Drosophila

Port F, Strein C, Stricker M, Rauscher B, Heigwer F, Zhou J, Beyersdörffer C, Frei J, Hess A, Kern K, Lange L, Langner N, Malamud R, Pavlović B, Rädecke K, Schmitt L, Voos L, Valentini E, Boutros M. Elife. 2020 Feb 13;9:e53865.

PMID: 32053108

Mehr erfahren
Exocyst-mediated apical Wg secretion activates signaling in the Drosophila wing epithelium

Chaudhary V, Boutros M. PLoS Genet. 2019 Sep 17;15(9):e1008351. PMID: 31527874

Mehr erfahren
Toward an integrated map of genetic interactions in cancer cells

Rauscher B, Heigwer F, Henkel L, Hielscher T, Voloshanenko O, Boutros M. Mol Syst Biol. 2018 Feb 21;14(2):e7656. doi: 10.15252/msb.20177656. PMID: 29467179

Mehr erfahren
β-catenin-independent regulation of Wnt target genes by RoR2 and ATF2/ATF4 in colon cancer cells

Voloshanenko O, Schwartz U, Kranz D, Rauscher B, Linnebacher M, Augustin I, Boutros M. Sci Rep. 2018 Feb 16;8(1):3178. PMID:29453334

Mehr erfahren
ERAD-dependent control of the Wnt secretory factor Evi

Glaeser K, Urban M, Fenech E, Voloshanenko O, Kranz D, Lari F, Christianson JC, Boutros M. EMBO J. 2018 Feb 15;37(4). PMID:29378775  

Mehr erfahren
Mapping of Wnt-Frizzled interactions by multiplex CRISPR targeting of receptor gene families

Voloshanenko O, Gmach P, Winter J, Kranz D, Boutros M. FASEB J. 2017 Nov;31(11):4832-4844. doi: 10.1096/fj.201700144R. Epub 2017 Jul 21. PMID: 28733458

Mehr erfahren
Secretion of Wnt ligands requires Evi, a conserved transmembrane protein

Bartscherer K, Pelte N, Ingelfinger D, Boutros M. Cell. 2006 May 5;125(3):523-33. doi: 10.1016/j.cell.2006.04.009. PMID: 16678096

Mehr erfahren